日本修士预科毕业发证吗？
这个要分学校来看，有的学校是会发给你的，例如东京大学的经济学研究科在2014年之前是不发毕业证的（东大本身就不发毕业证），只给一个证明书（东大的考试只要通过了笔试面试就可以拿到内诺，然后学习期限满后给个证明书，这种形式相当于你考上了，不过没毕业而已）；但是2014年以后东大经济学研究科也改成了和本校其他专业一样发放毕业证了（东大所有专业的毕业证都一样只有专业不同）。
另外像一桥大学、京都大学等以前是不发毕业证的，只给一个证明书（这里的一桥是大分县的一桥）现在是否还这样不确定；神户大学以前是发给毕业证的但现在不再发；
所以还是要看看你想报考的学校。 还有要看你想考的专攻，比如文法经史类的教授一般比较传统，会比较尊重过去的研究风气，会按照以前的制度来；而理工类的教授就比较“现代”一点，会考虑到学生是否有做研究的潜力等等，所以可能对你未来的研究方向会有影响（但影响都不会太大）